Una amenaza mortal de la historia de la Tierra reaparece y se lleva a cabo una búsqueda de un artefacto perdido entre Autobots y Decepticons, mientras Optimus Prime se encuentra con su creador en el espacio.

Martha Farnsworth dirige una escuela de educación exclusiva para mujeres en Virginia durante la Guerra Civil estadounidense. Para 1864, casi todos los estudiantes, profesores y esclavos han abandonado; solo quedan cinco estudiantes y una profesora, Edwina Morrow. Mientras está en el bosque buscando setas, Amy, una alumna, se encuentra con John McBurney, un cabo del Ejército de la Unión que resultó herido en la pierna durante una batalla y desde entonces ha desertado. Amy lleva a McBurney a la escuela donde cae inconsciente. Las mujeres encierran a McBurney en una de las habitaciones mientras la señorita Farnsworth cuida de sus heridas. Todas las mujeres y niñas de la escuela quedan inmediatamente fascinadas por el apuesto hombre.

Después de 19 años como prisionero, Jean Valjean es liberado por Javert, el oficial a cargo de la fuerza de trabajo de la prisión. Valjean viola su libertad y más tarde usa el dinero robado para reinventarse como alcalde y dueño de una fábrica. Por su parte, Javert promete llevar a Valjean de vuelta a la cárcel. Ocho años después, Valjean se convierte en el guardián de un niño llamado Cosette tras la muerte de su madre, pero la persecución de Javert significa que la paz tardará en llegar.

El capitán Colter Stevens (Gyllenhaal), que participa en un programa experimental del gobierno para investigar un atentado terrorista, se despierta en la piel de un viajero del tiempo cuya misión es vivir una y otra vez el atentado a un tren hasta que consiga averiguar quién es el culpable. Una oficial de comunicaciones (Farmiga) guiará a Stevens en su viaje a través del tiempo. En el tren el joven conoce a una viajera (Monaghan) por la que se sentira atraído

En la antigua Unión Soviética, Leo Demidov es un guardia de seguridad y antiguo héroe de guerra que cree fervientemente en Stalin. Pero cuando investiga una serie de asesinatos de niños, el estado lo releva de su cargo y lo aparta de la investigación para preservar la ilusión de una sociedad utópica libre de crimen. Demidov luchará entonces por encontrar la verdad tras estos asesinatos y la auténtica razón por la que el gobierno rehúsa reconocerlos. Por su parte, su esposa es la única que permanece a su lado, aunque quizá ella oculta también sus propios secretos.